UPN Veteran Yogyakarta yang semula bernama Akademi Pembangunan Nasional (APN) Veteran sejak didirikan berstatus sebagai Perguruan Tinggi Kedinasan (PTK) yang bernaung dibawah Departemen Urusan Veteran dan Demobilisasi RI. Pada 30 Juli 1965, APN Veteran ditingkatkan jenjangnya menjadi Perguruan Tinggi Pembangunan Nasional (PTPN) Veteran yang bernaung dibawah Dephankam RI. Pada 30 November 1977, diubah menjadi UPN Veteran dengan cabang Jakarta dan Jawa Timur. Pada 27 Februari 1993, oleh Menhankam ditetapkan UPN Veteran Yogyakarta dan kedua cabangnya berdiri sendiri-sendiri. Berdasarkan keputusan bersama Mendikbud dan Menhankam No. 037/0/1994-Kep/10/XI/1994 29 November 1994, maka terhitung mulai 1 April 1995 UPN Veteran Yogyakarta beralih status dari PTK menjadi PTS dan harus mandiri.

Menjadi Universitas Pionir Pembangunan yang dilandasi jiwa bela negara di era global

1. Menghasilkan lulusan yang berdaya saing global dan berjiwa bela negara melalui pembelajaran berkualitas
2. Mengembangkan konsepsi ilmu pengetahuan, teknologi, sains dan kemanusiaan melalui Pengembangan Program Studi/proses belajar mengajar dan pengayaan keilmuan
3. Meningkatkan kualitas penelitian melalui program terencana, terintegrasi dan berkelanjutan
4. Meningkatkan kualitas pengabdian kepada masyarakat melalui penguatan kerjasama antar institusi pendidikan, industri serta pemerintah
5. Mengembangan tata kelola universitas yang baik melalui manajemen mandiri, modern dan berkelanjutan dalam bidang SDM, keuangan, Sarana dan Prasarana serta TIK yang terintegrasi