Pada mulanya adalah Perhimpunan Pendidikan dan Pengajaran Kristen (PPPK) Petra yang didirikan pada 12 April 1951. Perhimpunan ini bercita-cita menyelenggarakan pendidikan mulai TK hingga SLTA. Pada tahun 1956 timbul pula gagasan mendirikan perguruan tinggi. Pada 21 September 1960, dibentuk Panitia Persiapan Perencanaan Pendirian Universitas, dengan anggota drg. Tan Tjiaw Yong, Gouw Loe Liong, drg. Tan Gie Djien, Tjoa Siok Tjoen, Lie Ping Lioe, dan Kwee Djian Kian. Setahun kemudian diputuskan untuk mendirikan Universitas Kristen Petra dengan Fakultas Sastra sebagai fakultas pertamanya. Fakultas Teknik Jurusan Teknik Sipil didirikan pada 15 September 1962. Pada 1996, dibuka program pascasarjana magister untuk Teknik Sipil yang berhasil terpilih sebagai mitra Asian Institute of Technology (AIT) Bangkok dalam menyelenggarakan Dual Master Degree (magister Teknik dan Master of Engineering) di bidang Teknik Sipil dengan Program Studi PETRAIT. Kerjasama ini memungkinkan peserta memperoleh pendidikan pascasarjana Teknik Sipil berkualitas internasional dengan biaya terjangkau. Secara berturut-turut hingga tahun akademik 2001/2002 berbagai fakultas dibuka, yang semakin memantapkan komitmen sivitas akademika -- peduli dan berwawasan global.

Menjadi universitas yang peduli dan global yang berkomitmen pada nilai-nilai kristiani.

Universitas memajukan dan memberdayakan masyarakat sebagai pengejawantahan nilai-nilai kristiani, melalui:

Kepedulian dalam ranah internal dan eksternal;
Wawasan global dalam wujud proses belajar